Podle informací médií čelí aktivisté nevládních organizací také obviněním ze špionáže a zločinného spolčení. Dále měli záměrně škodit řeckým bezpečnostním silám chránícím řecké pobřeží. Vyšetřování zločinných aktivit neziskovek probíhalo několik měsíců v široké spolupráci řecké kontrarozvědky (Národní zpravodajská služba), protiteroristické jednotky a klasické kriminální policie.
Řecká policie zatím odmítá zveřejnit podrobnosti a identitu obviněných. Podle poskytnutých informací se mezi obviněnými nachází jak řečtí občané, tak cizinci. Řečtí vyšetřovatelé tvrdí, že aktivisté nevládních organizací poskytovali pašerákům lidí informace, a to včetně tajných, o Řecku a situaci na hranicích, a pomáhali jim tak organizovat ilegální migraci z Turecka do Evropy. Podle řeckých vyšetřovatelů aktivisté neziskových organizací naváděli lodě převaděčů a ilegálních uprchlíků k řeckému pobřeží, doporučovali jim, kde přistát apod. Měli tak v poslední době pomoci několika desítkám lodí s ilegálními imigranty do Evropy.
Zásah řeckých bezpečnostních sil proti neziskovým organizacím se dostal do pozornosti i mimo Evropu. O zásahu například informoval své čtenáře i americký Washington Post. Přitom nejde o první obvinění nevládních organizací z pomoci v pašování ilegálních uprchlíků do Řecka z Turecka. Na webu panarabské televizní stanice al-Džazíra je dostupný článek o podobném případu z roku 2016, kdy řecké úřady obvinily z pašování lidí také aktivisty nevládních organizací (původem z Dánska a Španělska).
V kontextu celé věci je dobré připomenout, že nedávný návrh vedení Evropské unie o řízení migrace v EU obsahuje i plán na zákaz trestního stíhání aktivistů nevládních organizací, kteří zachraňují ilegální imigranty na moři (prakticky řečeno pomáhají ilegálním imigrantům v jejich překročení hranic členských zemí). Nevládní organizace by se tedy mohly stát prakticky beztrestnými organizátory nelegální migrace do Evropy.
